Las asociaciones miembro están representadas en RAICEX por la Asamblea General de Representantes (ARG), en la que se encuentran los presidentes y/o delegados de cada asociación.
Cada año, la AGR elige a las asociaciones que confirmarán la Junta Directiva (JD), que incluye los cargos de Presidencia, Vicepresidencia, Tesorería, Secretaría y las Vocalías.
Las Vocalías dirigen los comités, que trabajan en áreas de relevancia para misiones y el funcionamiento del RAICEX.
La JD con apoyo de la AGR, designa a la Secretaría General (SG), formada por el Secretario(a), su Adjunto(a), y tantos delegados como se consideren oportunos.
La SG apoya a la JD para un mejor funcionamiento de la RED, especialmente en tareas de representación y relaciones institucionales dentro y fuera de España.
Además, RAICEX cuenta con un Consejo Asesor Externo (CAE), elegido por la AGR, con fines de asesoramiento y representación, compuesto por profesionales en el campo de la ciencia, la tecnología y la innovación, de reconocido prestigio internacional, sin ninguna vinculación directa con las asociaciones miembro.